Генетическая эпидемиология ускоряет исследования вспышек заболеваний

Что принимать при низком уровне лейкоцитов в крови?Препараты для улучшения иммунитета и омалаживания (June 2019).

Anonim

Для борьбы с вспышками заболеваний должностные лица общественного здравоохранения часто используют кропотливую работу на местах, чтобы попытаться оставаться на шаг впереди зараженных ошибок, связывая симптомы пациентов с источником инфекции, чтобы быстро определить общего виновника в связанных случаях.

Теперь новое поле, называемое геномной эпидемиологией, использует быстро сокращенные затраты на секвенирование ДНК следующего поколения, чтобы лучше информировать должностных лиц общественного здравоохранения, с которыми сталкиваются постоянные вспышки. В расширенном онлайн-издании « Молекулярная биология и эволюция» авторы Didelot et al. разработал универсальный вычислительный инструмент, который может опираться только на геномные данные или настраиваться для добавления взвешенной информации из полевой эпидемиологии (например, время заражения, уровень зараженности, географическое положение и т. д.). Исследовательская группа проверила надежность нового инструмента против реального набора данных, чтобы восстановить передачу вспышки M. tuberculosis.

«Мы находимся на краю захватывающей новой эры в эпидемиологии общественного здравоохранения, поскольку геномика дает нам возможность реконструировать вспышки гораздо более подробно и с гораздо большей точностью, чем когда-либо прежде. В этом документе рассматривается важный вопрос - сколько информации о вспышке мы можем надежно получить только от геномных данных - и дает чиновникам общественного здравоохранения новый инструмент для своих детективов », - считают авторы Дженнифер Гарди, Кэролайн Колин и Ксавье Диделот.

С помощью своего инструмента они обнаружили, что им удалось уловить несколько аспектов известной эпидемиологии. Например, их метод правильно вывел наиболее вероятный исходный случай и несколько ключевых кластеров передачи.

Хотя авторы предупреждают, что геномика сама по себе не может по-настоящему заменить традиционную эпидемиологию, они показывают ценность и потенциал использования инструмента анализа данных последовательности в качестве вспомогательного метода для чиновников общественного здравоохранения, чтобы пролить свет на вспышки.